Monday, 18 August 2014

¿Cómo selecionar las mejores tags para artículos científicos en Mendeley?

Hola a tod@s,

En la entrada anterior hemos hablado de cómo gestionar de la mejor manera en Mendeley bibliotecas de un elevado número de artículos y cómo mantenerlas organizadas y funcionales a lo largo de los años y con el aumento de la complejidad intrínseca a la carrera del investigador/a.

En esta entrada hablaremos de cómo atribuir tags a cada artículo. El objetivo es poder iniciar una búsqueda bibliográfica a partir de tantos puntos conceptuales como posibles: ¿qué es lo que nos interesa? ¿La técnica, el sujeto de investigación, los materiales utilizados, los resultados, los efectos colaterales, etc...? Responderemos a la cuestión:

  • ¿Cuántas y qué tags tengo que atribuir a un artículo?



Estrategia:

Ante todo, las tags deben reflejar:
  1. las técnicas utilizadas
  2. el sujeto a estudio
  3. items relevantes mencionados
  4. conceptos no descritos pero que nos serán útiles en el futuro a lo hora de buscar. Este punto es más personal y dependerá de cada uno.
  5. ¿review?, ¿mini-review?, ¿tesis?, ¿book?
Veremos un ejemplo practico con el siguiente artículo.



El primer paso es identificar los puntos 1 a 5 en el título. Así, subrayamos los siguientes conceptos:


 en el título podemos identificar las siguientes tags:
  • Matrix Metalloproteinases (MMP)
  • MMP-1
  • Collagenolysis
El siguiente paso es hacer el mismo ejercicio en el abstract.


Con el detalle de este abstract podemos adicionar las siguientes tags:
  • collagen
  • protein flexibility
  • paramagnetic NMR spectroscopy
  • SAXS
  • x-ray crystallography
  • in solution
Lo mismo se puede hacer después a lo largo de todo el artículo mientras lo leemos.
Entonces, finalmente tendríamos estas tags que clasifican nuestro artículo:

  • Matrix Metalloproteinases (MMP)
  • MMP-1
  • Collagenolysis
  • collagen
  • protein flexibility
  • paramagnetic NMR spectroscopy
  • SAXS
  • x-ray crystallography
  • in solution
 Un ejemplo más ahora con este otro paper.



tags:
  • phosphorylation
  • Intrinsically Disordered Proteins
  • c-Src
  • In-cell NMR
  • Real-time NMR
  • NMR spectroscopy
  • kinases
  • phosphatases
  • Xenopus oocytes
  • egg extracts
  • MS
  • western blotting
  • kinase inhibition
  • CDKs
  • PKA
  • kinase-phosphatase networks

Con este conjunto de tags englobamos las técnicas utilizadas (NMR, MS, ...), los conceptos explorados (phosphorylation, ...) y el objeto de estudio (c-Src, egg extracts, Xenopus oocytes).

Así, los dos artículos usados como ejemplo, saldrán en una búsqueda dirigida a "NMR", pero serán diferenciados por todas las demás tags. Y lo mismo se aplica a otras tags y a cualquier otro paper.

Seguiremos hablando de este tema,
un saludo,
João

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